到香港科技大學參觀與學習 1~2/11(Visiting and Learning in Hong Kong University of science and technology---HKUST)

我家人認識史葛先生已有好幾年了, 他是一位60多歲的老外, 在退休前是在美國某大學從事生物化學研究的, 退休後不知為何來了澳門, 原本是過著悠閒的生活, 但不久便喜歡研究他的蟲類, 據聞很是瘋狂! 自己逢星期一至五留在香港科技大學自己的小小實驗角研究他的蟲, 星期五晚至星期一早上則回澳陪他的老婆... 他現在只是以訪問研究員的身份到HKUST研究, 幸好該中心給他每月1000大元的薪金, 但是他每月用在租房的開支都已是3000元; 而且HKUST離租房很遠, 連坐車和步行就差不多1小時了... 這樣大約一算, 每月就為了”興趣”就花費約5000元吧!?(還未計算吃和其他的開支呢...)

今星期六(11月1日)他老婆和我家四口, 陪著他回HKUST; 一來是讓小孩們感受科研的精神, 也可到西貢走走...

我問史葛先生HKUST在香港的整體排名為幾? 又有那些出名的學科呢? 原來整體來說若在第二名左右, 跟隨港大; 但以理科的研究能力應是第一, 商學院的素質也是不俗的(都是他講的). 他帶著我們遊了, 其他大學是在清水灣吧, 依山而建, 風景確是不錯! 到了他的實驗角, 滿是實驗儀器, 地方是擠擁的, 但還算是整齊和大呢... 加上適逢是大學生畢業的日子, 那些穿袍的周圍遊盪... 學術的風氛是很濃.

當然現在仍是”佔中”的日子, 大學的主廣場建築物仍掛著些橫額; 我想: 這在國內是見不到的; 若真的有, 早已被”幹掉了!”

說真的, 今次之旅, 除了感受過HKUST的環境和學術情況, 西貢的漁村風光外; 更是令我敬佩史葛先生對於科研的熱誠與執著... 年紀這么大! 身體雖尚可, 但走路已有點腿軟! 家和老婆都在澳門! 仍為了興趣而走到那麼遠, 付出那么多精神矣... 相反地, 我是否要多為前途和興趣想想, 不再為貪圖生活的安逸而苟且偷安...

估下什麼叫做"高等研究院"? 在那天我才知道...

Meta分析的改變 (The changing of Meta analysis!)

    我第一次接觸Meta分析，是2005-2006年讀碩士研究生時，在修讀科研方法學上研習的；當時教科研方法學的老師，其實都是教統計學的… 而教Meta分析的是林漢生老師！

    可能在當時Meta分析在國內仍是較新的事物，具實踐和豐富教學經驗的老師相信仍不多；記得林老師是用了1節課堂的時間講完了，而且重點是它的應用和結果的解釋上。

    隨著時間的過去，感知近年Meta分析在國內漸成熟及熱熾起來，我想應是它的文章都能發到較高IF的SCI期刊吧！在2010-2011年我留在南方醫科大學讀博時，就知道很多同學也是靠發Meta分析文章，達到符合大學最低的畢業要求。統計系的老師，也開了一門相關的課程(我也曾旁聽過一兩節，但感到與香港的有分別：香港的教學方式很實踐，而國內的仍很理論式)！

    今星期突然又想：事隔多年了，想重新學習，看看有什麼改變！真的有很大的改變啦~~~ 例如:

1.RevMan由4.2版到5.3版，版面美麗了很多，而且功能也豐富了不少。有興趣可閱讀以下的文章(寫得很好…) http://dl.vmall.com/c0owhof6mb

2.也有一些軟件對納入的研究文獻進行證據評價及推薦強度的判決。如：GRADEprofile 3.6；它現在也出了網絡版，只要簡單註冊便可在網絡上使用。

    時代不同了，世界在進步著…

中國大學體系之我見(My view of the system of Chinese universities)

    我不是大學體系的研究專家，但是近日讀到”中國校友會網”對”醫科大學”的排名；所以有感而發！

    在該網內的醫科大學排名，我讀博的母校”南方醫科大學”已位居第五！當然是值得開心的，但也不要盡信這些排名。因為影響的因素很多…

1.在國內，進行大學排名的評價主要有兩三個，就是武書連先生所研究的、上海交通大學的及中國校友會網的…(據我所知的就是這樣！若還有的望見諒)，它們的評價指標可能差距甚遠，所以結果(即排名)也相差可能很大呢~~~

2.近年來，國內的大學體系發生了很大的變化，如從以前較專科的大學(蘇聯式的)，慢慢地透過拼校而組成綜合大學(西方化的)。

    我是在90年代初到國內習醫的，當時盛傳著國內的五大醫科大學：協和、北醫大、上海醫大、同濟醫、中山醫。當然也有”北協和，南湘雅”的。而當年的暨大則是一所綜合性大學，是較特殊和少有的！旁邊還有華南師範大學、華南理工大學、華南農業大學。

    即當年及以前年代，以專科大學為主：如醫科大學、師範大學、理工大學、農業大學、文科大學為主。這樣的專科大學有其優缺點：如培養的人員較專業化；缺點是學科較單一，資源較集中等。

    但是自90年代末始，開始出現拼校的熱潮，如：北京醫科大學併入北京大學、協和醫科大學併入清華大學、浙江醫科大學併入浙江大學、中山醫科大學併入中山大學、同濟醫科大學併入華中科技大學等… 慢慢地走向綜合性大學的方向。綜合性大學的優點如，能與西方較好地接洽；能進行通職教育；資源共享也較方便；但缺點如某些專業性可能弱化… 當然！某些大學內的醫學院，仍是有很強的實力的！

    所以現在看著這份表，我感到並不能完全顯示了中國院校的醫科實力強弱，只能作為一種參考罷了…

一份研究報告明確指出引起癌症的危險因素歸因百分比! (A report shows the Attributable proportions of cancer’s risk factors! )

    剛剛又讀到一份美國癌症的研究報告，除了有關發病率等描述性研究外；還很好地標出了癌症各種的危險因素歸因百分比。這對於預防癌症是很有用的！

參考資料：

American Association for Cancer Research. AACR Cancer Progress Report 2014. Clin Cancer Res 2014;20(Supplement 1):SI-S112

http://cancerprogressreport.org/2014/Documents/AACR_CPR_2014.pdf

拜讀：台灣周碧瑟教授的手稿---現代流行病學(Reading Prof. Chow’s manuscript of ‘Introduction to Modern Epidemiology’)

    雖然該書有200多頁，但我僅花了約1周的時間，便把周教授的‘現代流行病學(手稿)’一書讀完了! 可能它是手稿的原因吧，沒有太多繁文縟節；加上我本身是流行病學博士，對於流行病學的內容及思想較瞭解吧!?

該書的優點是:

1.在內容編排上，都能將流行病學的思維流程體現出來。其實書中主要分為3部份，描述性流行病學、分析性流行病學及實驗性流行病學；將其他的內容，如：診斷與篩檢、信度與效度和偏倚(bais)等都融入到對應的章節中，很能體現流行病學作為科研方法學的特性。

    當然，在書的最後也補充了傳染病及癌症這兩種在現代社會常見病的教學內容。

    有時國內的一些書，將流行病學的內容分開了很多章節。有其好處！就是各內容都能很詳細地說明；但也是不足之處，有時在運用上就有些‘支離破碎’，不知從何開始的感覺…

    我個人感到：流行病學是一門應用性很強的學科，一定要全方瞭解及融會貫通，才能有把握及體會呢~

2.它的應用性很強，都舉了很多例子。而且最後也有實踐的作業題。

3.語言文字簡要精煉，但也是其弱點。因為若沒有聽過周老師的講課，作為一個初學者而言，有些例子是會不明白的。

    另外，如能加強現代電腦在流行病學方面應用，這就更好了！其實我也知周老師對於電腦的使用是有些限制呢…

    總體而言，這本書對於流行病學教學及其思維訓練是很好的選擇，有幸能讀到!

European Code Against Cancer: 12 Ways to Reduce Your Cancer Risk

    歐洲某組織打出了12個防癌建議, 其實細讀及思想一下, 這些建議都是日常且容易做到的健康生活的建議… 

European Code Against Cancer: 12 Ways to Reduce Your Cancer Risk

1	Do not smoke. Do not use any form of tobacco.
2	Make your home smoke free. Support smoke-free policies in your workplace.
3	Take action to be a healthy body weight.
4	Be physically active in everyday life. Limit the time you spend sitting.
5	Have a healthy diet: • Eat plenty of whole grains, pulses, vegetables, and fruits. • Limit high-calorie foods (foods high in sugar or fat) and avoid sugary drinks. • Avoid processed meat; limit red meat and foods high in salt.
6	If you drink alcohol of any type, limit your intake. Not drinking alcohol is better for cancer prevention.
7	Avoid too much sun, especially for children. Use sun protection. Do not use sunbeds.
8	In the workplace, protect yourself against cancer-causing substances by following health and safety instructions.
9	Find out if you are exposed to radiation from naturally high radon levels in your home. Take action to reduce high radon levels.
10	For women: • Breast-feeding reduces the mother's cancer risk. If you can, breast-feed your baby. • HRT increases the risk of certain cancers. Limit use of HRT.
11	Ensure your children take part in vaccination programs for: • Hepatitis B (for newborns) • HPV (for girls).
12	Take part in organized cancer screening programs for: • Bowel cancer (men and women) • Breast cancer (women) • Cervical cancer (women).

地理空間分析… 在流行病學的位置(Spatial analysis in Epidemiology)

    在流行病學的描述性研究中, 通常都會強調進行”三間分佈”, 包括：人間、時間、空間。這三間在取得研究數據後, 常需由統計學進行數據上的處理與分析。然而在過去的統計學軟件的發展中, 對人間的數據處理較集中, 如描述性統計分析都很成熟了；時間的數據處理在近代的統計學及其軟件也漸成熟, 如指數平滑法、時間序列分析等… 但是! 統計軟件較少能對地理空間的數據進行較好的處理, 如SPSS雖能進行簡易的地理空間描述及制作統計圖，但真的是”很簡單”! JMP(SAS的弟弟)也僅能作空間的簡易描述, SAS我不太熟識, 但聽聞也不是很好. STATA雖也能, 但不太穩定… R就更煩了, 因為要編一大堆程式!(起碼不是我個人的首選吧…)；這也間接令空間流行病學發展較晚有關吧!?

    因此, 對於地理空間數據作分析, 常需借助其他的專用軟件. 民間常用的軟件有ArcGIS、MapInfo、GeoDa、SatScan、EpiInfo及QGIS。誠然的, 我只用過MapInfo、GeoDa、EpiInfo及QGIS。

據聞：

1/ ArcGIS是該方面的大哥, 但體積很大, 就如統計軟件的SAS, 價錢很貴!

2/ MapInfo… 11版的體積約500M, 不大也不少, 但是… 我個人感覺它的制圖與EpiInfo差不多耶, 統計的功能也不多(很簡單的描述性分析), 它也是個收費軟件。

GeoDa、EpiInfo及QGIS都是免費軟件…

3/ GeoDa是一個不錯的空間分析軟件, 我感到它突出之處在於體積很少, 免安裝, 而且統計功能較多, 如：空間聚集分析(全局及局部), 時間空間滯後迴歸等… 所以需要對行較詳細及深入的分析, 是為首選! 但也有缺點, 就是制圖功能相對簡單.

4/ EpiInfo是美國CDC和WHO所研制, 它也結合了流行病學的資料收集及分析等. 在地理空間分析方面, 能很好地與Google map結合, 因此能很快地定位. 但是… 空間統計的功能仍是不多呢!

5/ 最後就是QGIS, 它最近出了2.4版, 在網上能找到免安裝的. 它制作的圖較美, 基本都好過MapInfo、GeoDa、EpiInfo. 雖然它的空間統計功能也較簡單, 但可以透過免費的擴充功能而作一定的補充, 另外, 也可以與很多的網上地圖搜尋器結合, 如Google Map, Yahoo等…

    2015年10月2日

QGIS最新已出了2.10版, 但網上沒有portable!
反而找到了2.8版 (swiss edition)的免安裝軟件, 可到下列地點下載: 
http://www.sourcepole.ch/produkte/interlis/ 

所以, 我現在基本上, 在地理空間分析時, 作描述及制作地理分佈圖時會用QGIS; 作空間統計時就用GeoDa!

當然, 希望將來會有一個免費, 而且功能強大, 包羅萬有的地理空間分析軟件吧!