Meta分析的改變 (The changing of Meta analysis!)

    我第一次接觸Meta分析，是2005-2006年讀碩士研究生時，在修讀科研方法學上研習的；當時教科研方法學的老師，其實都是教統計學的… 而教Meta分析的是林漢生老師！

    可能在當時Meta分析在國內仍是較新的事物，具實踐和豐富教學經驗的老師相信仍不多；記得林老師是用了1節課堂的時間講完了，而且重點是它的應用和結果的解釋上。

    隨著時間的過去，感知近年Meta分析在國內漸成熟及熱熾起來，我想應是它的文章都能發到較高IF的SCI期刊吧！在2010-2011年我留在南方醫科大學讀博時，就知道很多同學也是靠發Meta分析文章，達到符合大學最低的畢業要求。統計系的老師，也開了一門相關的課程(我也曾旁聽過一兩節，但感到與香港的有分別：香港的教學方式很實踐，而國內的仍很理論式)！

    今星期突然又想：事隔多年了，想重新學習，看看有什麼改變！真的有很大的改變啦~~~ 例如:

1.RevMan由4.2版到5.3版，版面美麗了很多，而且功能也豐富了不少。有興趣可閱讀以下的文章(寫得很好…) http://dl.vmall.com/c0owhof6mb

2.也有一些軟件對納入的研究文獻進行證據評價及推薦強度的判決。如：GRADEprofile 3.6；它現在也出了網絡版，只要簡單註冊便可在網絡上使用。

    時代不同了，世界在進步著…

中國大學體系之我見(My view of the system of Chinese universities)

    我不是大學體系的研究專家，但是近日讀到”中國校友會網”對”醫科大學”的排名；所以有感而發！

    在該網內的醫科大學排名，我讀博的母校”南方醫科大學”已位居第五！當然是值得開心的，但也不要盡信這些排名。因為影響的因素很多…

1.在國內，進行大學排名的評價主要有兩三個，就是武書連先生所研究的、上海交通大學的及中國校友會網的…(據我所知的就是這樣！若還有的望見諒)，它們的評價指標可能差距甚遠，所以結果(即排名)也相差可能很大呢~~~

2.近年來，國內的大學體系發生了很大的變化，如從以前較專科的大學(蘇聯式的)，慢慢地透過拼校而組成綜合大學(西方化的)。

    我是在90年代初到國內習醫的，當時盛傳著國內的五大醫科大學：協和、北醫大、上海醫大、同濟醫、中山醫。當然也有”北協和，南湘雅”的。而當年的暨大則是一所綜合性大學，是較特殊和少有的！旁邊還有華南師範大學、華南理工大學、華南農業大學。

    即當年及以前年代，以專科大學為主：如醫科大學、師範大學、理工大學、農業大學、文科大學為主。這樣的專科大學有其優缺點：如培養的人員較專業化；缺點是學科較單一，資源較集中等。

    但是自90年代末始，開始出現拼校的熱潮，如：北京醫科大學併入北京大學、協和醫科大學併入清華大學、浙江醫科大學併入浙江大學、中山醫科大學併入中山大學、同濟醫科大學併入華中科技大學等… 慢慢地走向綜合性大學的方向。綜合性大學的優點如，能與西方較好地接洽；能進行通職教育；資源共享也較方便；但缺點如某些專業性可能弱化… 當然！某些大學內的醫學院，仍是有很強的實力的！

    所以現在看著這份表，我感到並不能完全顯示了中國院校的醫科實力強弱，只能作為一種參考罷了…

一份研究報告明確指出引起癌症的危險因素歸因百分比! (A report shows the Attributable proportions of cancer’s risk factors! )

    剛剛又讀到一份美國癌症的研究報告，除了有關發病率等描述性研究外；還很好地標出了癌症各種的危險因素歸因百分比。這對於預防癌症是很有用的！

參考資料：

American Association for Cancer Research. AACR Cancer Progress Report 2014. Clin Cancer Res 2014;20(Supplement 1):SI-S112

http://cancerprogressreport.org/2014/Documents/AACR_CPR_2014.pdf

拜讀：台灣周碧瑟教授的手稿---現代流行病學(Reading Prof. Chow’s manuscript of ‘Introduction to Modern Epidemiology’)

    雖然該書有200多頁，但我僅花了約1周的時間，便把周教授的‘現代流行病學(手稿)’一書讀完了! 可能它是手稿的原因吧，沒有太多繁文縟節；加上我本身是流行病學博士，對於流行病學的內容及思想較瞭解吧!?

該書的優點是:

1.在內容編排上，都能將流行病學的思維流程體現出來。其實書中主要分為3部份，描述性流行病學、分析性流行病學及實驗性流行病學；將其他的內容，如：診斷與篩檢、信度與效度和偏倚(bais)等都融入到對應的章節中，很能體現流行病學作為科研方法學的特性。

    當然，在書的最後也補充了傳染病及癌症這兩種在現代社會常見病的教學內容。

    有時國內的一些書，將流行病學的內容分開了很多章節。有其好處！就是各內容都能很詳細地說明；但也是不足之處，有時在運用上就有些‘支離破碎’，不知從何開始的感覺…

    我個人感到：流行病學是一門應用性很強的學科，一定要全方瞭解及融會貫通，才能有把握及體會呢~

2.它的應用性很強，都舉了很多例子。而且最後也有實踐的作業題。

3.語言文字簡要精煉，但也是其弱點。因為若沒有聽過周老師的講課，作為一個初學者而言，有些例子是會不明白的。

    另外，如能加強現代電腦在流行病學方面應用，這就更好了！其實我也知周老師對於電腦的使用是有些限制呢…

    總體而言，這本書對於流行病學教學及其思維訓練是很好的選擇，有幸能讀到!

European Code Against Cancer: 12 Ways to Reduce Your Cancer Risk

    歐洲某組織打出了12個防癌建議, 其實細讀及思想一下, 這些建議都是日常且容易做到的健康生活的建議… 

European Code Against Cancer: 12 Ways to Reduce Your Cancer Risk

1	Do not smoke. Do not use any form of tobacco.
2	Make your home smoke free. Support smoke-free policies in your workplace.
3	Take action to be a healthy body weight.
4	Be physically active in everyday life. Limit the time you spend sitting.
5	Have a healthy diet: • Eat plenty of whole grains, pulses, vegetables, and fruits. • Limit high-calorie foods (foods high in sugar or fat) and avoid sugary drinks. • Avoid processed meat; limit red meat and foods high in salt.
6	If you drink alcohol of any type, limit your intake. Not drinking alcohol is better for cancer prevention.
7	Avoid too much sun, especially for children. Use sun protection. Do not use sunbeds.
8	In the workplace, protect yourself against cancer-causing substances by following health and safety instructions.
9	Find out if you are exposed to radiation from naturally high radon levels in your home. Take action to reduce high radon levels.
10	For women: • Breast-feeding reduces the mother's cancer risk. If you can, breast-feed your baby. • HRT increases the risk of certain cancers. Limit use of HRT.
11	Ensure your children take part in vaccination programs for: • Hepatitis B (for newborns) • HPV (for girls).
12	Take part in organized cancer screening programs for: • Bowel cancer (men and women) • Breast cancer (women) • Cervical cancer (women).

地理空間分析… 在流行病學的位置(Spatial analysis in Epidemiology)

    在流行病學的描述性研究中, 通常都會強調進行”三間分佈”, 包括：人間、時間、空間。這三間在取得研究數據後, 常需由統計學進行數據上的處理與分析。然而在過去的統計學軟件的發展中, 對人間的數據處理較集中, 如描述性統計分析都很成熟了；時間的數據處理在近代的統計學及其軟件也漸成熟, 如指數平滑法、時間序列分析等… 但是! 統計軟件較少能對地理空間的數據進行較好的處理, 如SPSS雖能進行簡易的地理空間描述及制作統計圖，但真的是”很簡單”! JMP(SAS的弟弟)也僅能作空間的簡易描述, SAS我不太熟識, 但聽聞也不是很好. STATA雖也能, 但不太穩定… R就更煩了, 因為要編一大堆程式!(起碼不是我個人的首選吧…)；這也間接令空間流行病學發展較晚有關吧!?

    因此, 對於地理空間數據作分析, 常需借助其他的專用軟件. 民間常用的軟件有ArcGIS、MapInfo、GeoDa、SatScan、EpiInfo及QGIS。誠然的, 我只用過MapInfo、GeoDa、EpiInfo及QGIS。

據聞：

1/ ArcGIS是該方面的大哥, 但體積很大, 就如統計軟件的SAS, 價錢很貴!

2/ MapInfo… 11版的體積約500M, 不大也不少, 但是… 我個人感覺它的制圖與EpiInfo差不多耶, 統計的功能也不多(很簡單的描述性分析), 它也是個收費軟件。

GeoDa、EpiInfo及QGIS都是免費軟件…

3/ GeoDa是一個不錯的空間分析軟件, 我感到它突出之處在於體積很少, 免安裝, 而且統計功能較多, 如：空間聚集分析(全局及局部), 時間空間滯後迴歸等… 所以需要對行較詳細及深入的分析, 是為首選! 但也有缺點, 就是制圖功能相對簡單.

4/ EpiInfo是美國CDC和WHO所研制, 它也結合了流行病學的資料收集及分析等. 在地理空間分析方面, 能很好地與Google map結合, 因此能很快地定位. 但是… 空間統計的功能仍是不多呢!

5/ 最後就是QGIS, 它最近出了2.4版, 在網上能找到免安裝的. 它制作的圖較美, 基本都好過MapInfo、GeoDa、EpiInfo. 雖然它的空間統計功能也較簡單, 但可以透過免費的擴充功能而作一定的補充, 另外, 也可以與很多的網上地圖搜尋器結合, 如Google Map, Yahoo等…

    2015年10月2日

QGIS最新已出了2.10版, 但網上沒有portable!
反而找到了2.8版 (swiss edition)的免安裝軟件, 可到下列地點下載: 
http://www.sourcepole.ch/produkte/interlis/ 

所以, 我現在基本上, 在地理空間分析時, 作描述及制作地理分佈圖時會用QGIS; 作空間統計時就用GeoDa!

當然, 希望將來會有一個免費, 而且功能強大, 包羅萬有的地理空間分析軟件吧!

我博士入學考試時的一道統計題目.(One question of Statistical exam of my Ph.D enrollment)

我是在2009年決定報考南方醫科大學公共衛生與熱帶醫學學院流行病系2010級的博士班的. 在澳門, 報讀國內的研究生課程, 常是由高等教育辦公室負責統一報名及考筆試, 報名的日期常在上一年的12月份, 而考筆試日期則會安排在當年的4月份吧, 地點常是培正中學! 至於面試, 則由報考者和學系自行聯絡.

由於我報考的是流行病學系, 所以要考的英文、流行病學、衛生統計學. 其中衛生統計學就出了一道：什麼是Simpson’s Paradox?

說真的, 我沒有這個概念, 因為碩士研究生沒有教過、老師沒有提過、更重要的是國內的教材很少有相關的內容啊… 當時答什麼我也記不起了！我想只是亂答一通呢~~~ 哈哈… 當然之後我有查閱相關的內容, 也知道了是什麼.

前天在某圖書館, 隨手拿來一本統計學書籍“統計學的世界”, 見到相關的介紹…

 

澳門是否有需要建立一所醫學院嗎?(Does it need a medical college in Macao!?)

    近日在報章中, 讀到一位醫院高層人員說: 已委託澳門大學研究, 在澳門建立一所醫學院… 而另一所私立大學的高層也說同樣的話!

    我不知道他們說這些話的論點建基在何? 也不知有沒有循證依據(Evidence based); 言而我聽到會有一陣的納悶. 主要的原因如下:

1. 環顧鄰近的地區, 都有醫科大學和醫學院, 如廣州有：暨大醫學院、中山醫學院、南方醫科大學、廣州醫科大學… 台灣有：國立台大、高雄醫學大學等…

估計每年都有約30至60名醫學畢業生回澳吧!(我相信這是保守了一點的數字…)

2. 現在澳門年輕的, 在醫院外的醫生也不少! 每次政府與某大學共同開設的”臨床輔導班”, 基本有約100人報讀的. 當然其中有些是複讀的.

3. 既然如此, 是否有一個機制, 將這些醫學畢業生培訓, 以符合澳門的醫療體系呢? 這比建立一所醫學院還要實際呢!

4. 澳門的醫生聘請及培養機制, 在我眼內是完全沒有長遠計劃的… 例如在2000-2010年, 基本只是隔數年才開考一次, 每次都是招收10~20多人, 以應付需要. 而2010年以後, 應建離島新醫院的建立, 以及民間多人臭罵：”看病難”, 才草率地大量招聘. 但是同時又修改主治醫生(IC)的培養制度, 由2年加多至6年左右…

嗚呼! 這樣可做成一代人成為”陪葬品”(我就是了, 我1999年畢業, 我們這一代人很多都轉行了… 做診所的、考公務員的、做藥商的、莊荷的…)

就算是現在有機會入到醫院工作, 也要在基層做好多年, 沒有多大晉升的機會…(理由! 不言而喻…)

5. 至於有人說, 建個醫學院, 有機會提高澳門醫學科研的能力. 說實在的, 在澳門現在只顧搏彩業, 只重”科技”! 以及各機構對科研的氛圍… 除非是政府牽頭帶動醫學科研, 否則只是空談, 或淪為某些人的謀財途徑(當然, 我不排除是會有些”有心人”的)

又早前我讀了一份新聞紙, 作者也是討論相關的問題, 觀點雷同…(忘記了何時剪下的! 抱歉)

以上僅為個人的愚見, 不一定正確… 哈哈!

拜讀吳喜之教授的兩本統計學書籍, 收獲甚豐!(Reading two statistical books of Prof. Ng, those are very good!)

    其實很早就已得悉國內中國人民大學的吳喜之教授在統計學是登峰造極.
    在7月5日至12日因公務學習的原因, 有機會到北京1星期, 期間曾到王府井大街的書店, 便買下了他的"統計學---基於R的應用"課本; 急不及待地閱讀了!
    書本不厚, 內容也不深奧; 是一本很好的統計學入門書籍! (當然作為像我這樣讀了較多統計的人, 是有點簡單的!) 但是也有它的買點, 就是對於國內的一些統計概念有所批判思考! 同時也
是學習R統計軟件的好材料啊~

    隨後繼續閱讀他的"複雜數據統計方法---基於R的應用"; 這本書對於我來說是較匹配的, 因為閱讀它需要一定的統計學基礎.

    該書內, 他根據數據的性質分類作對應的統計方法, 也介紹了較現代的統計方法, 如: 機器學習、降維、時間序列等... 然而由於R的編程較複習, 所以對我沒有編程基礎的人來說, 雖是學習R的好材料, 但有點吃力...

    其實我有將一些兩本書內的意見電郵給吳教授, 他很好, 都有給我回覆, 並說明了些情況, 以及介紹我閱讀一些材料, 真是感謝他呢~~~

向台灣的流行病學大師---周碧瑟教授學習(Stay with the great master of Epidemiology---Prof Chow! Wow...)

    突然收到D秘書的電郵, 告知楊副教授今年(2014年)因工作原因, 未能到學院來教授公共衛生原理課...
    好吧! 於是我和D秘書嘗試盡力找找適合的人選呢!
    聯繫過一些學者, 都被婉拒了! 說實在的, 這樣的事已是習以為常, 試問人家在沒有介紹的情況下, 為何來澳門這個地方講學呢?
    試試她吧! 是台灣陽明大學公共衛生學院的周碧瑟教授... 但她在台灣的流行病學界是頗有名的, 心裏忐忑著她會否答允?
    後來周教授答允了, 且因是公共衛生原理課, 所以她將一半的課時, 交由食品藥物管理署的副署長---吳秀英老師教授, 實是感恩...
9月13日至14日是吳老師的授課, 她第一時間便講了現時台灣最具爭議的公共衛生突發事件---地溝油, 也從中帶出了公共衛生的概念、原理等; 授課中與學生們作了很多互動與交流, 讓課堂的氣氛很熱烈...

    而9月27日及28日則是周碧瑟教授上課. 在第一天, 她就在這8小時內將現代流行病學的精華內容講述了一遍... 她的語言簡要, 而課本是選用她的手稿, 它確是 Modern Epidemiology的精華版呢!

    由於我已在國內讀過流行病學, 聽起來更是有一番滋味~, 與國內的教學內容很是不同!

    第二天就主要講述她如何建立台灣離島的基礎衛生站, 台灣的肺結核防治等內容...

    [2015年10月2日]

     今年周教授於9月18日再度來澳門某大學的健康科學學院任教－公共衛生原理課中的－流行病學部份...
    18日那晚我們又再聚首吃飯! 估不到的是: 周教授都記得我們上年談及過的話題呵! 而我也詢問了她很多人生的哲理之事... 席間周教授問我有否意願在明天試教流行病學的課, 她可在台下作指導老師及作補充. 瞬間我感到無限的喜悅, 因為老師樂意灌輸知識及能力於我; 但過後我郤有很多的無奈: 因我是一個公職人員, 不能兼任; 而且每年都有部份修讀課程的學生是我以往的學生啊... 更何況我已離開教職約有4年了, 我的"功力"已不復當年勇...
    後來周教授知道我的情況, 收回了試教, 叫我好好地做好當前的工作.
    實在是感恩老師的恩典...

    19日全天8小時的流行病學課, 我也旁聽了. 周教授調整了講課的深度, 使課程更輕鬆易懂. 課前她更給了我一本書! 我也要她簽上名字以作留念! 我會把它讀完的~

 [2016年10月8日更新] 

    今年的9月23日, 周教授再來了, 數數已是第3年的來臨! 每次都很珍惜能和教授相聚的時間, 因為不單可以長知識, 更能在人生的道路上有頓悟!

    更何況澳門搞流行病的專家學者有多少人?
橫琴某大學的健康科學院, 職員通常都是搞生物技術, 統計等的...
飛機場旁邊的某大學健康科學學院, 更是...;
疾病預防控制中心的, 基本都是碩士程度, 並大多是做實務工作的...
    難覓知音人!!!

[2017年9月30日更新]

    今年已是第4年周教授來澳教學了, 當然要與她聚聚!
    第4年旁聽周教授的流行病學講課, 自有另一翻"領悟"! 開始"嗒"出當代流行病學的"味道"!(誠言, 我不是一個聰明人, 所以要旁聽咁多次:-P)
    周教授小息期間問我: 旁聽了這么多次, 仍有收獲嗎? 我沒想地回答說: 當然仍有!
    我心內形容: 第一年旁聽時, 非常痛苦! 因為腦袋快裂開 (因為我學的是傳統流行病學, 而她教的是當代流行病學). 第二年旁聽時, 開始知道她說什麼. 第三年旁聽時, 嗒出當代流行病學的味道了. 第四年旁聽時, 基本了解啦!
    感恩老師...

[2018年9月15日更新]

    今年的上半年, 突然收到D主任的通知: 周教授今年不來了!
    我內心很感無奈且矛盾: 無奈的是周教授是台灣流行病學界的佼佼者, 向她學習是一種福氣, 因可增長知識; 而且其中也加插了"佛語", 讓人的靈性成長... 此一別, 不知能否"後會有期"?
    周教授已年長了, 誠言兩天的講課, 對一位長者來說, 是有點吃力的!
    今年的9月9日及10日又是原定的公共衛生原理課, 而流行病學部分改由林敬恒教授來授課; 當知悉周教授在今年初1月榮休了, 很是為她高興.
    但願她能快樂, 健康地生活, 感恩教授這4年的教導! 感恩你給予的書及簽名! 感恩你的佛語分享! 感恩你對學院的貢獻... 太多太多的感恩... 想念教授...