向台灣林敬恒教授學習流行病學 (Learning Epidemiology from Prof. Lam)

    今年初收到D主任的微信留言, 告知周教授今年不來澳門教授流行病學了.

    內心泛起驚訝: 

"不是吧!? 

不是周教授身體抱恙?(因周教授已是長者) 

按理今年應是輪流到我宴請周教授, D主任她們用餐呵, 那麼樣辦呢..."

    經過協調, 今年林敬恒教授到來授課, 代替周教授, 我想必是周教授的細選與安排, 實是感恩周教授的造福.
    特意地在網絡上找過林教授的個人資料, 以便課前更多的瞭解. 但找到的不多, 只知是年青的, 在台中榮總醫院工作呵.

    在9月8日至9日是林教授來澳授課的日子, 由於我是旁聽人員, 應在上課前先向老師說聲好. 誰不知與老師初見面, 除了握手外, 更知悉老師已在互聯網上閱過我的資料, 哈哈! 我心想我只是在澳門工作的一個小小流行病學工作人員唉... 原來D主任已在早前向老師說了, 有"條戇居友"會來旁聽呢...
    謝謝老師的教學, 今年又吸收了些新知識, 如: 大數據及實證流行病學, 精準醫療等, 這些都是流行病學近年的前沿研究啊... 期望日後能多些向林教授學習知識...

投稿科研文章之路2---終於等到結果 (The road of contribution of scientific article 2---The result !)

介紹信的樣式

    按上文撮要,
1.寫好了文章,
2.註冊了"網上投稿"系統,
3.把文章投到系統內.
    接著... 就是要呈交些文件, 這是較繁瑣的步驟, 因為我的老師在內地廣州, 很多時要郵寄文件給老師確認及蓋科室的印章...

1.首先要交的是"论文著投送介绍信及授权书"

    它可在確認投稿的電郵內找到下載地址.
1.1 填寫好後, 郵寄給廣州的老師(這一步已花了約11天: 7月8日寄出, 19日老師告知才收到), 要她簽名, 並蓋上科室的印章;
2.2 然後把文件先掃瞄及電郵給我, 以便先電郵給雜誌社, 讓他們盡快開始審稿. 再將文件正本郵寄給雜誌社.

2.再回網上投稿平台

    再次回到平台, 已經看到稿件狀態改為"審理中", 現在是靜待結果的時刻...

3.終於等到了結果

    在9月3日下午, 我終於收到了手機短訊, 它是由中華預防醫學雜誌社發出的. 大意是：請查看投稿系統及郵件中的退修意見!
    於是... 我就打開了登記的郵箱, 已見到:

稿件狀態改為審理中, 期望有好的回覆...

中华XXXX杂志 稿件退修通知

尊敬的陈XX老师：
   您好！请您点击下方链接关注本刊官方微信，随时关注稿件审理状态。若未关注，可能会耽误您稿件流程，所致后果自理。

您的稿件 ZHYF-2018-XXXX-XXXXX ... ...已经通过《中华XXXX杂志》编委会审理，本文修改后可被本刊考虑录用，请仔细修改。具体修改意见请见系统中编辑修改稿或一审编辑意见。

    1、投稿修稿问题：您需要登录您投稿时采用的中华医学会网站（http://uip.cma.org.cn/main.do） 进行文章的查阅与修改。请在网站的左上角输入您投稿时注册的用户名/密码。输入用户名后点击“个人业务办理”然后点击“远程稿件管理系统”，即可看到退修稿，请在此基础上对论文进行修改。修改后的稿件也请通过此步骤上传修改稿。

您的修改质量会对您文章的发表时间产生很大影响，请认真对待。对于一审编辑意见（或审稿专家意见）需要逐条回复，回复内容请列于修改稿文档中，文章正文之上。修改稿中编辑意见需要逐条回复，回复于修订批注中即可。根据中华医学会杂志社的相关规定，当论文的主体是以人为研究对象的试验时，作者应该说明其遵循的程序是否符合负责人体试验的委员会（单位性的、地区性的或国家性的）所制定的伦理学标准，并通过受试对象的知情同意。

2、著作权问题：鉴于文章的著作权问题，请您确认是否已将著作权转让书寄予编辑部，如尚未邮寄请点击以下网址：http://www.~~~~.cn/cn/xiazai/sqs.pdf，下载授权书并打印，请所有作者按顺序签名，单位盖章后将著作书原件寄予以下地址：北京东四西大街42号116室，中华预防医学杂志编辑部收，邮编100710，电话010-85158377。

3、版面费收取问题：《中华预防医学杂志》从2005年1期开始改为铜版纸印刷，彩图随文。无彩图文章500元/面，有彩图需要在版面费的基础上另缴1000元彩图制作费（一张或几张彩图均收取1000元）。如您不同意请在修改稿中第一行注明，如不注明默认为认可。

4、修改时间：请注意您的修改时间及质量，自退修之日起计算，并于15天内修回，或不认真修改，无法达到发表要求者，本刊将做退稿处理。

感谢您对《中华预防医学杂志》的支持与厚爱，您的支持是我们最大的动力！

本刊继往发表文章查询，本刊相关信息查阅请登陆本刊官网：www.~~~~.org.cn

                                                  中华XXXX杂志编辑部

去到投稿系統,也見到了"一審意見":

【审稿决定】： 退修

【审稿意见】： ... ...

拟刊登栏目：短篇论著。

後記[2020.08.22]  最後約1年前，收到雜誌社的通知，仍是拒稿了... 很感無奈!  接著入冬及年初的疫情，沒有理會稿件。唉!  是我的不好!

科研的屍體解剖(Autopsy of science)

碩導老師在微信分享了一篇文章，是他為某書寫的導論，對其中一段說話很有感觸！
因有些朋友找我，就是为他/她的科研做“屍体解剖”！其實我很想說: 我只能盡力，“死馬當活馬醫”。但能不能，结果如何？只是天意！

投稿科研文章之路(The road of contribution of scientific article)

    寫這個Blog(博客)的目的, 是希望能幫到想或有需要投稿科研文章的朋友, 尤其是投到內地核心期刊的讀研究生朋友!
    這篇Blog可能會比較長, 因為我想盡力把整個投稿過程表達出來... 並適時會修改! 望能見諒.

    作為一個具博士學歷的人, 研究及發表文章 (這裡的文章是指"科研文章") 是很自然的事! 當然, 已畢業的我, 再沒有發表一定文章數量的"壓力"; 現在發表文章的動機, 更多是為了興趣與博士的使命感...

    另外, 有時與朋友, 尤其是些正在讀研究生課程的朋友交流時, 得悉他們都"苦"於如何發表文章! 即無去路---不知如何去投稿? 投到那所雜誌社去?..., 又要被迫發表---因為現在很多大學都要求研究生畢業時, 要發表一定數量的文章; 如碩士研究生至少要在"核心期刊"以第一作者發表一篇; 博士研究生至少要在SCI以第一作者發表一篇, 或在核心期刊至少發表兩篇等, 具體情況要視乎不同的大學與專業學科而定啊.
    我心想: 既然決定要讀研究生, 就預定了要發表文章啦! (廣東話說: 食得咸魚抵得渴)! 倒不如好好地鑽研這一"技能"吧!

1.投稿前的準備及注意事項

    投稿要準備的事是不少的, 也不能"馬虎":
1.1    寫好一篇文章: 寫文章時, 要盡量參考你想投稿到的雜誌社的文章格式, 如: 文章的版面格式, 參考文獻的格式(GB-7714-2005, 還是APA 6th)與引用格式...  如果是投SCI文章, 更應細讀投稿網頁內的"作者"事項.
         而且應盡力把文章修改好, 經導師或通訊作者審閱好, 才投出去呵!
         因為這些都是代表你的"誠意"及"負責任"的態度呢~
1.2    要瞭解那些期刊是"核心期刊": 我們通常指的是北大中文核心期刊, 最新應是2014年版. 找到你想投稿的專業界別, 如: R1 预防医学、卫生学 內的... 決定好你要投稿的雜誌.
1.3    確定好你文章的內容, 是否與投稿的雜誌辦刊方向"對口": 如護理的文章, 就不應投到預防的雜誌, 否則拒稿風險較大啦! 當然, 最好文章內容不要涉及些政治等問題.

2.投稿去

圖1  網頁登入界面

    準備好了文章及"自我"審查後, 便可開始投稿"旅程", 當然! 不包"一定生仔":
2.1    現在一般都用"網上投稿"的方式投稿. 例如我常投到中國內地的中華系列, 他們已有自己的網上投稿平台: http://sso.cma.org.cn/sso/login?service=http%3A%2F%2Fuip.cma.org.cn%2Fmain.do (見圖1)

         登錄入系統或註冊一個新的用戶! 即可進入該中華系列的網上投稿平台(見圖2)

圖2 投稿平台

         2.1.1    進入平台後, 首要登記成為那本雜誌的作者, 才可能投稿到那本雜誌的.
在剛開始的網頁, 會見到以下內容:
欢迎使用远程稿件管理系统 申请成为杂志作者
點選藍色子"由請成為雜志作者", 隨後就可見到一列雜誌的名稱, 想文章投到哪, 就鈎選哪雜誌.
之後就可在圖2的1處, 選擇你想投稿的雜誌社了...

2.2 投稿: 點選圖2的2處-->作者投稿, 就會出現圖3的訊息.
     到這裡, 有一個技巧, 就是它有數個頁面資料要填的, 一定要一次完成所有資料的填寫, 否則不能投稿的.

圖3 投稿的資料

    同時, 它要你投稿前提供介绍信及授权书, 內需要有單位蓋章, 各位作者的簽名等. 一般要集齊簽名及蓋章後, 先掃瞄及電郵給雜誌社, 讓雜誌社開始審稿; 然然郵寄正本給雜誌社呢...
    當你完成上述的投稿資料輸入後, 會在註冊的電郵內收到雜誌社的確認電郵:

中华XXXXX杂志 投稿成功通知

尊敬的陈XX先生：     非常感谢您对本刊的关注与支持！ 您可以登录投稿系统，查询稿件处理情况，投稿系统会更新稿件的处理进度，投稿系统请登录：http://www.cma.org.cn/ywzx/index.html。 如果您想查询更多关于中华预防医学杂志的信息，可以登录以下网址：http://www.XXXX.org.cn/。您也可以关注我们的微信，关注方式：搜索“中华XXXX杂志”，点击关注。     请您将论文著投送介绍信及授权书(下载地址：http://qk.cma.org.cn/cma2-qk/data/para/sqsCn.PDF)、基金证明复印件（省以上各类基金）等材料的扫描电子版发送到编辑部邮箱 XXXX@cma.org.cn，我们会在看到您的邮件后尽快安排文章的送审。电子资料提交后，请您尽快将纸质版的资料邮寄到以下地址：北京市东四西大街XX号中华XXXX杂志编辑部；邮政编码：100710。     为了增加稿源，更好的服务读者，本刊自2015年起，免收审稿费。     本刊编辑人员负责专业及联系方式：... ...

■ 稿件的详细信息为：  *稿件编号： ZHYF-2018-XXXX-XXXX *稿件题目： 应用XXXX澳门地区XXXX情况

參考資料:

1. GB-7714-2005: https://gradschool.ustc.edu.cn/ylb/material/xw/wdxz/19.pdf
2.北大中文核心期刊: http://lib.hhu.edu.cn/news/show-270.html
                                     http://lib.hhu.edu.cn/upload/201704/12/201704121414100956.pdf
3.介紹信及授權書: http://chinaepi.icdc.cn/config/zhlxbx/news_category/2014-08-27/%E4%BB%8B%E7%BB%8D%E4%BF%A1%E5%8F%8A%E6%8E%88%E6%9D%83%E4%B9%A6.PDF

使用GeoDa研究地理流行病學 (Using GeoDa software for Geographic Epidemiology)

    在流行病學中的描述性分析部份, 最基本的是: 人, 時, 地的分佈描述(也就是所謂的三間分佈: 時間, 人間, 空間. 在中國內地, 可能也會教授"移民流行病學", 因為它可說明了地理因素與人遺傳因素, 對疾病發生的影響. 在台灣, 也會教授APC模型---即年齡-時代-世代研究模型)!

    在三間分佈的描述中, 發展得最慢, 或者說最後期的是空間分佈的描述. 原因是受限於GIS(地理信息系統)的研究與發展... 據知, GIS最先研究於Canada, 而研究的動機, 是因為當時的戰爭需要... ...(其實Internet也是因戰爭而出現吧!)

    隨著GIS研究成功, 全球衛星定位系統的出現(GPS), 電腦軟件的配合. 空間研究逐漸成熟. 若將空間研究應用到流行病學中, 就成了: 地理流行病學...

    現在近行空間研究的軟件很多, 有著名的ArcGIS, QGIS, GeoDa... 有商業軟件, 也有開源免費軟件.
    ArcGIS是商業軟件, 功能很多, 模块亦整全. 但據知很貴, 而且體積也很大!
    QGIS是免費軟件, 功能也很多. 但體積也不少.
    而GeoDa既是免費軟件, 功能也不少, 且體積不大! 是我很喜歡的! 可以結合QGIS 和/或SaTScan, 應足以應付一般的地理流行病學研究的需要啦...
    近日放假1星期, 於是好好研究一下GeoDa, "發挖"一下有沒有可以寫文的題材! 在實際的功能上, 它可以作:
1.地理分佈圖;
2.地理的統計圖;
3.數據與地圖聯合分析
4.空間聚集分析
5.空間回歸分析...
    誠言, 在這些功能上, 可以研究流行病學在地理空間內有否聚集現象, 以及引起聚集的原因! 真的很感恩研發者的貢獻呵...

僅分享我對一篇有關中國的科研文章看法 (Just sharing my view of an article which is about scientific research in China)

    近日從手機的娛樂資訊內讀到一篇報導, 說中國科研情況!

  
說中國的科研文章的"產量", 已佔全球科研文章產量的第2位. 但被引用的排名就只有第15位. 反映了產出的文章雖然多, 但創新性及在科研中的貢獻不多...

    其實我在想, 這是與中國的教育情況及評核職稱有關!

試想想, 在中國內地, 乃至華人地區, 都鼓勵兒童要把課文"背"好, 把"字"寫好; 甚少鼓勵兒童去創新和發掘新事物, 思考事情. 我記得有一次, 與一位中學生交談時, 得知他們快要考數學了, 但是他們要去背公式, 背考題的... 實在是令人斐然. 試問這種教育背景下的孩子, 如何做創新研究呢???

    再談評核職稱, 現在不單在中國內地, 連澳門也是, 某些機構在職位晉升的評審中, 發表科研文章的"分數"佔了一定的比例. 然而, 這些職位既不是科研職位, 工作中能用到科研的機會也不高, 這些人員對科研的認識也不深. 結果是: 為了評得上晉升, 就"粗制濫做"了一些文章, 東抄西寫... 只求能發表, 有數量, 沒有質量...

    所以有些人, 為了達到發表文章的目的, 於是就去試"走偏門", 其中最快也最常見的就是"抄襲", 甚至有歪論說: 天下文章一大抄!

   [題外話: 這也催生了多門生意---論文代寫(俗稱: 槍手), 代發文章的機構... 亂象叢生! 成為已公開的秘密, 為國際所恥笑...]

    

    為了防止抄襲, 學術機構近年也出現了"查重"(在電腦內查核文章中的段落重覆情況, 然後設定重覆率不超過20%...) 但是除了可防止一部份的抄襲外, 對於文章質素低下又有何用呢~

    當然, 亂象並不是中國特有, 近年如日本, 韓國, 美國等地區也偶有聽聞. 然而只是中國特別多.

    要處理這個問題... 很難!
要從教育的根本制度去斗正(防止家長再"拜分數"主意很難.)
要從評核的根本制度去斗正(阻人去晉升, 只求質量, 不求數量... 很難.)

    這條路還是很遠呵...

大數據與R統計分享 (Sharing Big Data and R statistical Language)

    自從我研究統計, 尤是"衛生統計學"後(2005年開始吧!) 統計學近10多年有著很大的改變... 其中之一就是出現了"大數據"的概念.
    我記得研究生時, 教我統計學的老師, 仍是說: 抽樣... 由樣本統計量推向參數... 然而, 大數據因為大得可怕, 動輒就是數個GB, TB 甚至是PB的儲存量, 數據資料也來自廣大人群, 又何需要抽樣... 當然, 它的代表性及數據背後的意義與價值, 又是另一回事吧!
    所以一值都想學習大數據的處理與分析.
    自己也一直有些擔憂: 自己的沒有強的數學背景, 對統計或數學的理解不容易; 沒有很好的電腦編程基礎呵...

    近日從網絡上看到一本"被"掃瞄的相關書籍: 大數據分析: R基礎與應用. 便下載回來學習.
    該書不厚, 約有150多頁,內有些R語言編程及圖表說明, 所以我讀的較快 (約花了1個月吧!)
    它主要分開4部分:
1.大數據的基礎知識;
2.R統計語言的基礎知識與使用技巧;
3.一些較高級的統計內容與數據挖掘(Data Mining);
4.大數據分析的基本分析方法...
    總的來說, 前3部分還是寫的不錯, 言駭意簡. 但第4部分就寫得不好, 因為很多數學推導的內容, 而R實踐部分就"簡略"了很多; 讓我有感"接不下去"的感覺(或許是我這方面的知識膚淺呢!).
所以它適合有統計學基礎的讀者呵...

    好! 繼續努力~

澳門腸道病毒感染的時空分析 (Spatial temporal analysis of enterovirus infection in Macao---My new artical is published in Chinese Journal of Epidemiology)

    這篇文章的題目是"我国澳门地区2011－2016年肠道病毒感染时空分析". 被刊登在中華流行病學雜誌上.
    其實從題目, 就可知道它的內容了...

    但想分享的, 是要感恩兩位指導老師: 
第一位是姜老師, 因為它對於內容中使用的時空分析法, 提出了很多寶貴的意見; 另外, 在數據質量一般的情況下, 如何確保樣本的代表性? 姜老師也花了些心神特別提醒晚輩的我.
第二位當然是我的博導---陳老師, 由內容的修訂, 簽署的文件, 乃至投稿的費用, 都花了很多的腦汁...

    其次, 想說的是, 已工作的我, 要寫科研文章投稿, 不是易事! 因為一來數據來源貧乏, 很難寫出好的科研文章. 其次工作與家庭, 孩子的照顧, 已花了很多的精神呵...
    但作為科研中人, 發表文章是..."能力可及則應盡力而為的事"
    繼續努力...

有關SPSS的系列文章(A serial articals of SPSS)

    在中國內地, 研究生的統計教育, 基本都是教及使用SPSS統計軟件的; 我在讀研時也不例外!
    使用SPSS統計軟件的好處, 是它不用撰寫程式, 而且結果很多; 只要在"選單"上點選要分式的方法, 然後在結果頁選取所需的結果就好了... 當然, 隨著使用統計的年資增長, SPSS的不足之處也出現, 如:
1.它是商業軟件, 即要買使用執照的呵... 對學生而言, 有點困難.
2.使用的重覆性較差: 不同的人, 點選項不同, 可能出現不同的結果. 即結果的重覆出現軟差.
3.不能使用較新的統計方法, 畢竟是商業軟件, 更新是稍慢的.
4.對眾多的結果, 選擇及解釋上有時會出現困難.
5.對於繼續理解統計學是會造成障礙的. 因為它的很多選項及結果都是"預定"的, 所以為什麼要用這種統計方法前, 要驗證它的假設前題等, 只會"知其然而不知其所以然"...

    但是, 有時為了"偷懶", 也為能與其他人"溝通"(畢竟SPSS仍是很多人用的), 自己也會用SPSS先做一次統計, 又或去驗證統計結果是否正確.
    在4月初, 因工作關係, 無意中讀到一系列的SPSS的教學/使用文章! 很好的... 詳細及深入.
值得一讀的.

下載SPSS系列文章地址: https://pan.baidu.com/s/1b2r6SNrNhOXU6V7ccp4Wzg

一份學習R統計軟件的好讀物(A very good reading material of R statisitcal package))

    近日, 內地有位人士, 將學習R統計軟件比較好的讀物~<R語言實戰>, 閱讀後制成筆記形式. 並分享到某個內地有名的網站內.
    當然我第一時間把它下載回來, 並花了春節假期約10天的時間, 一口氣地讀完了! 很好呵~ 內容很齊全, 不但容易閱讀, 亦可很容易地理解它的思路.
    這位"人士"強調了: 該筆記資料不能作商業用途, 僅能作學習之用. 是值得尊敬的呢...
    現把它分享, 網址如下:


分享網址: https://pan.baidu.com/s/1iy3lDHfUWp8iJ3XcdNOcAQ

向賴教授學習流行病學(Studing epidemiology from Prof. Lai)

    記得在上年秋, 我已在記事本內標註著今年初要旁聽流行病學課. 由於種種的原因, 以往的教師因未能抽空來澳門任教該科目, 所以今年邀請了台灣有名的賴錦皇教授. 
從互聯網上, 得悉賴教授是從有名的美國學府畢業, 而且是台灣某高校的系主任, 應是十分猛料的... 這機會實是不可錯過!

    初次見到賴老師, 知悉他是來自台灣國防高校的, 應是很男子氣勢的吧! 但在交談中, 他語氣很文雅(又可能是因講課時間太長, 要沉著音量吧?) 及有禮貌呵...
    賴老師教的是"高級"流行病學內容. 曾教過流行病學的我, 知道這部份是很難教的... 原因是涉及的數學推論較多, 較難明白及讓學生理解. 而賴老師引用了很多的例子, 並逐步把內容講解呵... 而我也學到了很多新知識, 且明白了很多以往"似懂非懂"的事, 如醫院選擇性偏倚, 交互作用...
另外, 我們也分享了中國內地及台灣流行病學的教與學; 教學上的一些難點; 我也在完成課程後, 再複習了講義一遍, 再對內容鞏固一些... 我相學生們要更努力啊... 

    很感恩賴老師這兩個周末日的教學呵...

上述兩本流行病學讀本是賴老師推薦的教材, 都是哈佛的學者編寫的...

學習流行病學很好的讀物(Very good reading materials of study epidemiology))

    流行病學按不正式的劃分, 可分為"古代"流行病學及"近代"流行病學".
古代流行病學, 因應當時的社會環境, 很大部份是研究"傳染病"流行病學, 如John Snow的霍亂...
隨著社會環境及衛生條件的改善, 人類的疾病譜也改變, 死亡原因以往主要是傳染病引發, 改變為主要是慢性非傳染性疾病引起. 流行病學的重點也改變了, 近代流行病學主要的內容是研究方法學...

    學習近代流行病學, 主要的好處是可瞭解疾病的研究方法, 以及如何將結果更精準...
    學習流行病學的材料很多, 但很多都是些片斷的閱讀材料, 又或是些很深奧的. 適合初學者的, 可參考如下:
1. 世界衛生組織的入門讀物：
Basic epidemiology
它有中文版本的---基础流行病学
這讀本的內容很簡易, 一目瞭然; 然而內容郤很全面...

2. 另外, 美國CDC也有流行病學的讀物: Principles of Epidemiology in Public Health Practice
這本讀物內容則較實踐的!